营利事业承包工程，应留意营业税二项规定，高雄国税局表示，首先，承包工程依税法规定，应於工程合约每期收款时开立发票；其次，即便因逾期完工或违约等因素，减少原本应收的工程款，剩余未开期数的发票，仍应如期开立、报缴营业税。
官员表示，发票是我国营业税制度的重要凭证，为了让营业人有遵循依据，《加值型及非加值型营业税法》当中，有附上「营业人开立销售凭证时限表」，依据该表规定，营业人承包工程时，应按工程合约所载每期应收价款时，分别开立发票。
举例来说，承包商包下总价300万元的合约时，预计在三个月内完工，并分期在每个月请款100万元，期间的三个请款日，皆须依合约各别开立发票。
然而在实务上，厂商未必能顺利履约，官员表示，特别在尾款未收足额时，常会违反税法规定。
以上述300万元合约为例，双方约定逾期完工时，需支付100万元罚款，若承包商打算以工程尾款来抵付，就会形成免收第三个月尾款，却须在合约约定期间开立发票、报缴营业税的情形。
官员表示，承包工程遇到违约，坊间常见的做法是以减收剩余工程款，作为支付合约赔偿款的方式，但是在税务的认定上，工程劳务的买卖确实有发生、应开立发票并报缴营业税；至於赔偿款，则相当於另一笔和交易直接相关的劳务，视个案情形而定，通常是受款方有开立发票的义务。
官员强调，营业人於承包工程时，如发生违约而须支付罚款时，罚款仍归罚款、工程款归工程款，工程款须应依原订时限开立发票，就算是以工程款抵付罚款，也不得因此免除开立发票、报缴营业税的义务，提醒营业人依相关规定办理，以免遭补税及处罚。
摘自经济日报2022.02.17
